1、本机使用前，接通电源，打开开关，空机转动1-2分钟确认机器运转正常后，方可开始工作。
2、用医用酒精擦洗滚筒内壁及药丸相接触的部位，做消毒处理。
3、制丸前准备，起模：将小米煮熟后，用标准筛去掉较大颗粒，筛选出统一规格的较小颗粒。在筛选出的小米表层洒一层药粉，并晃动筛子，使小米表层包裹一层中药粉末。至此，形成制水丸所需的模子。
4、将模子倒入水丸机滚筒，开启机器，使模子在滚筒内做圆周运动，用长勺往滚筒内两侧洒中药粉末，同时用喷壶往滚筒内底部喷雾状清水。不断重复此步骤，使模子不断滚大，直至形成所需规格大小的水丸。注意：在操作过程中，可用长勺勺出少许药丸，观察水丸是否已达到所需规格大小。
5、出料：用随机所配塑料毛刷及铲子伸入滚筒内，仍在做圆周运动的水丸即掉入铲子内，即可取出药丸。注意：出料过程中机器不能停止运转，否则将影响水丸形状。
6、抛光方法：将筛选好的水丸放入滚筒内，使水丸连续翻滚，滚动时间越长，水丸表面越光滑。
7、烘干方法：水丸在抛光过程中，打开电加热开关，即可将药丸烘干。